Анімаційна стрічка розповідає про першу зустріч Скубі та Шеґґі, яким судилось стати нерозлучними друзями. А також про те, як вони познайомились з юними детективами Фредом, Вельмою і Дафною та разом заснували відому компанію Mystery Inc. На друзів чекає найскладніша справа в історії: їм потрібно розгадати таємничу змову – спробу випустити у світ собаку-привида на прізвисько Цербер. Відчайдушна команда прагне спинити цей глобальний «собакаліпсис». Однак згодом вони дізнаються, що Скубі має загадкове минуле і долю епічнішу, ніж будь-хто тільки міг уявити!